يرتكز صندوق التنمية الزراعية في أعماله وأنشطته المختلفة على مبدئين أساسيين يتمثلان في التنمية المستدامة والحفاظ على البيئة؛ إذ يسعى الصندوق إلى تحقيق الاستدامة بمعناها الشامل في كل ما يقدمه من خدمات وما ينفذه من مشروعات، واضعاً نصب عينيه دائماً تطبيق التنمية المستدامة بمفهومها الشامل، ومعتمداً في ذلك على خطط عمل مدروسة يتمكن من خلالها من الاستفادة من كل الموارد المتاحة دون المساس بحق الأجيال القادمة في هذه الموارد، كما أن نهج صندوق التنمية الزراعية يسير بالتوازي مع خطط التنمية المتعاقبة للمملكة العربية السعودية